在Linux环境下，如果使用copydir()函数时遇到问题，可按照以下步骤排查并解决故障：

1. 核实文件路径：确认源目录与目标目录的路径无误，检查路径内是否存在拼写错误或是无效的目录。
2. 验证权限设置：保证对源目录和目标目录具备相应的访问权限。通过ls -l指令查看目录权限，并利用chmod命令调整权限（如需）。
3. 检查磁盘容量：确保目标目录所在磁盘拥有足够的剩余空间以容纳复制的数据。
4. 审核文件系统状态：保证源目录与目标目录所在的文件系统处于良好状态。可借助df -h命令监控磁盘使用率，并运用fsck工具检测文件系统（必要时）。
5. 分析程序逻辑：保证copydir()函数被恰当调用。核查函数参数配置是否准确，同时妥善处理潜在异常情况。可采用perror()函数输出错误提示。
6. 浏览系统记录：执行dmesg命令查阅系统日志，或许能从中获取与当前问题相关的线索。
7. 升级操作系统及应用：保持Linux系统及其相关组件为最新版本。可使用sudo apt-get update与sudo apt-get upgrade命令完成系统的升级操作（适用于Debian系平台）。

若上述手段仍无法排除故障，请进一步提供具体的错误描述，这将有助于更精准地定位并解决问题。